孵化器位于新泉城大厦A座，主要承担优质医疗资源先期聚集、医学科学机构先期布局的任务。设新一代医疗技术、第三方医学检测试验、健康医疗大数据研发应用、人工智能与医疗器械研发、远程国际医疗服务、人类遗传资源共享服务等6大功能板块，是济南国际医学科学中心承接国际高端医学科研成果转化、高端创业人才聚集的重要抓手。孵化器为入孵企业提供“大管家”“店小二”式全方位、全过程服务，为医学中心主片区建设发展输送项目、企业和人才。